Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmco5aQ9D9D5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmco5aQ9D9D5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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