Protein–RNA interactions for Protein: Q9D924

Isca1, Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isca1Q9D924 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Isca1Q9D924 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Isca1Q9D924 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Isca1Q9D924 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms