Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snx5Q9D8U8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snx5Q9D8U8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snx5Q9D8U8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snx5Q9D8U8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms