Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rexo2Q9D8S4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms