Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn22Q9D7U6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn22Q9D7U6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn22Q9D7U6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn22Q9D7U6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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