Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms