Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9D7E4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D7E4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D7E4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms