Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc94Q9D6J3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms