Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sec23bQ9D662 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms