Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc130Q9D516 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc130Q9D516 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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