Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D454 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D454 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D454 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D454 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D454 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D454 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Q9D454 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D454 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms