Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rnf128Q9D304 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf128Q9D304 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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