Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Trappc6bQ9D289 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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