Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtf2e1Q9D0D5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtf2e1Q9D0D5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms