Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mms19Q9D071 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mms19Q9D071 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Mms19Q9D071 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mms19Q9D071 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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