Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Elp3Q9CZX0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Elp3Q9CZX0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms