Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thumpd2Q9CZB3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thumpd2Q9CZB3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms