Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc8Q9CYA6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc8Q9CYA6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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