Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl11Q9CXW4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms