Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Xrcc3Q9CXE6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Xrcc3Q9CXE6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Xrcc3Q9CXE6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Xrcc3Q9CXE6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Xrcc3Q9CXE6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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