Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RpainQ9CWY9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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