Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smurf1Q9CUN6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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