Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snw1Q9CSN1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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