Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q9CRC3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms