Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Nicn1Q9CQM0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms