Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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