Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med4Q9CQA5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med4Q9CQA5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms