Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SdhbQ9CQA3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SdhbQ9CQA3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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