Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rnaseh2cQ9CQ18 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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