Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms