Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nup155Q99P88 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms