Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hdac9Q99N13 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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