Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms