Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gps1Q99LD4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms