Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd1bQ99JY6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms