Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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