Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pacsin3Q99JB8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pacsin3Q99JB8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pacsin3Q99JB8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pacsin3Q99JB8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Pacsin3Q99JB8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Pacsin3Q99JB8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pacsin3Q99JB8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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