Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cdk9Q99J95 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdk9Q99J95 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cdk9Q99J95 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cdk9Q99J95 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cdk9Q99J95 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cdk9Q99J95 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cdk9Q99J95 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cdk9Q99J95 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cdk9Q99J95 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cdk9Q99J95 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdk9Q99J95 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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