Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smim11aQ99J19 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smim11aQ99J19 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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