Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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