Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spdl1Q923A2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms