Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trim59Q922Y2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms