Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms