Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms