Protein–RNA interactions for Protein: Q920M7

Syt17, Synaptotagmin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt17Q920M7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt17Q920M7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms