Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nek8Q91ZR4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Nek8Q91ZR4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nek8Q91ZR4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms