Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lims2Q91XD2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lims2Q91XD2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms