Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setd3Q91WC0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Setd3Q91WC0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms