Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rhbdd2Q8VEK2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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