Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srsf4Q8VE97 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms